1) najprawdopodobniej wszystkie, ponieważ kabel USB to nic innego jak emulator portu COM aczkolwiek sam testowałem tylko do wersji 409,1
2) nie mam pojęcia
3) VCP (stosunek ceny do jakości dość dobry, no i można wiele rzeczy nim zrobić), VCDS (1800zł - porównywalny z urządzeniem fabrycznym) V-scan - tester diagnostyczny, który jest najtańszy z tych wszystkich, ponoć robi wszystko to co powyższe, ale skaner to skaner

eepromu na przykład nie zmienisz
wybór należy do Ciebie.